Nel 1999, da Varese, la Sielco si sposta nella zona industriale di Buguggiate, in via Rossini, dove è presente la sede attuale con i suoi 58 dipendenti e i 1.700 metri quadrati di area. In questi anni lo sviluppo, continuo e costante, di software sempre più accessibili al grande pubblico innesca il processo di informatizzazione non solo di tutte le aziende del territorio di Varese, ma anche della pubblica amministrazione e, soprattutto, della sanità.
Ancora oggi, sono clienti della Sielco quasi tutti i presidi ospedalieri di Varese e provincia e moltissime amministrazioni comunali, a cui si aggiungono gli oltre 350 studi di consulenza fiscale e del lavoro.